インデックス

検索エンジンのデータベースに登録される事を指します。
(インデクシングと言う人もいるようです)

上位表示うんぬんは別として、検索エンジンの検索結果に表示される為には、インデックスされなければなりません。
データベースに登録されていないホームページが表示されるはずがありませんので。

サイトの規模が大きく(ページ数が多く)なればなるほど、全てのページを検索エンジンにインデックスさせるのは難しくなり、ホームページの中でのリンクの張り巡らし方を工夫したり、サイトマップページを作ってそれぞれのページに直接移動できるような道を作ってあげる必要があります。

インデックスはホームページ単位ではなくページ単位で行われてますので、1ページでも多く検索エンジンにインデックスされたほうがSEO的にも効果的だとされています。
(ページの構造やペナルティの対象となるページをのぞいて)